22 Nisan 1951 yılında doğdu. 1972 yılında Kara Harp Okulundan, 1973 yılında ise Piyade Okulundan mezun oldu. 1973-1982 yılları arası Hava İndirme Tugayı, 7. Hudut Taburu, Dağ Komando Okulu ve Eğitim Merkezinde görev yaptı. 1974 yılında Hava İndirme Tugayı 1. Paraşüt Taburundan takım komutanı olarak Kıbrıs Harekâtına katılan Pekin, 1984 yılında Kara Harp Akademisinden mezun oldu ve 1984-1987 yılları arasında 61. Piyade Tümeninde Harekât Eğitim Şube Müdürlüğü ve İstihbarat Şube Müdürlüğü görevlerini aynı anda üstlenen Pekin, 1987 yılında Silahlı Kuvvetler Akademisinden mezun oldu. Aynı yıl girdiği Kara Kuvvetleri Eğitim Komutanlığında 1991 yılına kadar görev aldı. 1991-1994 yılları arasında Brüksel TMR Başkanlığında Kara Plan Subaylığı yaptı ve 1994 yılında 1. Mekanize Piyade Tugayı Kurmay Başkanı oldu. 1995 yılında bu görevinden ayrılarak 5. Hudut Alay Komutanlığı görevine getirildi. 1997-1998 yılları arasında Kara Kuvvetleri Genel Plan Prensipler Savunma Araştırma Şube Müdürlüğü yaptı. Aynı yıl 30 Ağustos 1998 tarihinde tuğgeneralliğe terfi etti ve 1998–2000 yılları arasında Kara Kuvvetleri Plan Harekât ve Teşkilat Daire Başkanlığı, 2000–2002 yılları arasında 66. Zırhlı Tugay Komutanlığı görevlerini yaptı.
30 Ağustos 2002’de tümgeneralliğe terfi etti ve 2002-2005 yılları arasında Kara Kuvvetleri Personel Başkanlığı, 2005-2006 yılları arasında 4. Kolordu Komutan Yardımcılığı ve 1. Mekanize Piyade Tümen Komutanı olarak görev yaptı. Yine 30 Ağustos 2006’da korgeneralliğe terfi etti. 2006-2007 yılları arasında ise 8. Kolordu Komutanlığı görevini yaptı. Ağustos 2007’de Genelkurmay İstihbarat Daire Başkanlığı görevine atandı. İngilizce, Fransızca ve Arapça bilen İsmail Hakkı Pekin Kıbrıs Barış Harekatı bronz liyakat madalyası sahibidir. 2012 yılında emekliye ayrılmıştır.
2017 yılında GMKA SAVUNMA SANAYİ İTHALAT İHRACAT ANONİM ŞİRKETİ‘nde Yönetim Kurulu Başkan Yardımcısı ve ayrıca 29 Ekim 2023’te kurulan GMKA VAKFI Kurucu, Mütevelli Heyeti ve Yönetim Kurulu Başkan Yardımcısı olarak hayatına devam mektedir.